Государственное автономное учреждение Ярославской области «Государственная экспертиза в строительстве» возникло в начале 1992 года во исполнение Постановления Главы администрации Ярославской области от 30.01.1992 г. №61 «Об управлении государственной вневедомственной экспертизы».

Управление государственной вневедомственной экспертизы осуществляло свои функции в период с 1992 по 1997 гг.

- На основании Постановления Правительства Ярославской области от 19.02.1997 г. №27-п Управление государственной вневедомственной экспертизы было переименовано в Управление государственной вневедомственной экспертизы Ярославской области и осуществляло свои полномочия в период с 1997 по 2003 гг.

- На основании Постановления Администрации Ярославской области от 11.06.2003 г. №115 «О создании ГУ ЯО «Яргосстройэкспертиза» и ликвидации Управления государственной вневедомственной экспертизы Ярославской области», в соответствии с Законом Ярославской области от 08.12.2000 г. №28-ФЗ «О порядке осуществления права собственности в отношении собственности Ярославской области» и целях дальнейшего совершенствования работы по экспертизе проектно-сметной документации на строительство и ремонт объектов, подлежащих финансированию за счет бюджетных средств, Управление государственной вневедомственной экспертизы Ярославской области после ликвидации было преобразовано в государственное учреждение (ГУ), с присвоением соответствующего правового статуса. ГУ ЯО «Яргосстройэкспертиза» существовало в период с 2003 по 2007 гг.

- На основании Постановления Правительства Ярославской области от 16.08.2013 г. № 1049-п «О внесении изменений в постановление Администрации Ярославской области от 24.12.2007 г. №728-а «О создании государственного автономного учреждения Ярославской области «Государственная экспертиза в строительстве» и внесении изменения в постановление Администрации области от 03.10.2001 г. №141», установлено, что функции и полномочия учредителя ГАУ ЯО «Яргосстройэкспертиза» от имения Ярославской области осуществляло Правительство области. Функционально Учреждение было подчинено Правительству области и закреплено за первым заместителем Губернатора области – Председателем Правительства области.

- В соответствии с постановлением Правительства Ярославской области от 5 сентября 2014 г. № 869-п «О передаче функций и полномочий учредителя и внесении изменений в постановление Администрации области от 24.12.2007 № 728-а» функции и полномочия учредителя государственного автономного учреждения Ярославской области «Государственная экспертиза в строительстве» от Правительства Ярославской области были переданы департаменту строительства Ярославской области.

По настоящее время ГАУ ЯО «Яргосстройэкспертиза» осуществляет свою деятельность в указанном правовом статусе и функциональной подчиненности.